In anul 1942, Bugs Bunny era personajul central al seriei Merrie Melodies,care initial dorea sa creeze personaje pentru un singur episod. "Bunny gets Boid"( iepurele ia pasarea) marcheaza o mica modificare a lui Bugs- dintii din fata sunt micsorati, iar capul este mai rotund. Omul din spatele "reconfigurarii" este Robert McKimson. Aceasta modificare a lui Bugs a fost folosita initial doar in episoadele realizate de McKimson si echipa lui, dar in timp aceste trasaturi au fost adoptate si de catre ceilalti producatori. McKimson a creat o noua versiune a lui Bugs cu ochii mai alungiti, dinti mai lungi si o gura mult mai mare, pe care le-a folosit pana in 1949, cand a inceput sa foloseasca versiunea pe care a creat-o initial.

Episoade din 1942: "Hold the lion, please" ( tine leul, te rog), "Fresh Hare"( iepure proaspat), "The Hare- Brained hypnotist" ( hipnotizatorul cu creier de iepure)- care l-a adus pe Elmer la dimensiunile originale, "Case of the missing hare" (cazul iepurelui disparut). De mentionat faptul ca a aparut intr-un film comercial de 2 minute la obligatiuni de razboi.

Bugs a fost popular in cel de-al Doilea Razboi Mondial pentru ca avea o atitudine libera si usoara. In anul 1943, desenele cu Bugs Bunny erau cele mai profitabile din SUA. La fel cum au facut si alte case de productie, Warner l-au pus pe Bugs in opozitie cu cei mai mari inamici ai vremii: Adolf Hitler, Benito Mussolini si japonezii. Episodul din 1944 "Bugs Bunny Nips the Nips" (Bugs Bunny pisca piscaturile) il prezinta pe acesta la intamplare cu un grup de soldati japonezi. Acest episod a fost retras de pe piata din cauza stereotipurilor rasiale.

De cand a debutat in "A wild hare" Bugs a aparut doar in desenele color ale Merrie Melodie.

Printre episoadele din aceasta perioada se numara: "Tortoise wins by a hare"( broasca testoasa castiga printr-un iepure), "A corny concerto"( un concert batjocoritor), "Falling hare"( iepurele cazator), "What's cooking Doc?" ( ce se gateste doctore?) si "Super- rabbit"( super- iepurele) o parodie la adresa filmului Superman. In acest episod, Bugs a purtat uniforma celor din Marina Americana si datorita acestui motiv, a fost numit Sergent.

Intre anii 1943-1946, Bugs a fost mascota oficiala a Aviatiei americane. In 1944 apare intr-un desen produs de Paramount- compania rivala a Warner. Acesta apare in medalion si spune fraza"Trebuie sa fiu in desenul gresit", dupa care dispare in gaura din care aparuse.